AIが解く世界の難問 · 医学・創薬 · arXiv · 2026-10-26
分子最適化の前に探る：構造ベース創薬におけるLLMエージェント向けプローブ誘導型最適化
原題: Probe Before You Edit: Probing-Guided Molecular Optimization for LLM Agents in Structure-Based Drug Design
構造ベース創薬でLLMエージェントがリガンドを改良する際、結合親和性と薬物様性を同時に改善することは難しい。本研究は、単一の編集で両方が改善する頻度などを測る2つの診断指標を導入し、現行のLLMエージェントは分子編集がポケットへどう影響するかを知らないまま編集しているため、同時改善がまれであることを示した。これを受けて、制御された類似体編集の応答を用いるPROBEを提案した。PROBEはサイトマップとEditManualに基づく反復的なマルチエージェント最適化を行い、CrossDocked2020ベンチマークで最先端の性能を達成し、診断で示された失敗モードを大きく緩和した。