AIが解く世界の難問 · 生命科学 · Nature (machine learning) · 2026-10-05
ProFormer: 深層学習による単一細胞およびプラズマプロテオームの汎用的な分類
原題: ProFormer: generalizable classification of single-cell and plasma proteomes using deep learning
プロテオミクスの従来のワークフローは処理能力が低く、大規模なデータの迅速な試料分類を妨げていた。ProFormerは、質量分析で得られたペプチドイオンのMS1レベルの特徴量を直接入力とするトランスフォーマー型の深層学習モデルである。14の評価対象アーキテクチャより高い分類精度と汎化性能を示し、単一細胞プロテオームを細胞種・細胞周期・分化過程で、血漿プロテオームから患者の疾患状態を分類できたと報告されている。