AIが解く世界の難問 · 医学・創薬 · arXiv · 2026-10-19
3次元ファーマコフォアを用いた分子の生成的進化（MEVO）による構造ベース創薬の効率化
原題: Generative molecule evolution using 3D pharmacophore for efficient Structure-Based Drug Design
構造ベース創薬では、高品質なタンパク質–リガンド複合体のデータが不足していることと、生成された分子を合成できるかという課題がある。本研究はMEVOを提案し、反応テンプレートから作られた反応経路で学習した反応認識型の生成モデルを、ポケット認識型の進化戦略に組み込んだ。粗い推定と厳密な絶対結合自由エネルギー摂動（ABFEP）計算を組み合わせた階層的なスコアリングで分子を反復的に改良し、KRAS G12Dという難しい標的に対して既知の活性阻害剤に匹敵する親和性の阻害剤を設計できたと報告されている。