AIが解く世界の難問 · 生命科学 · arXiv · 2026-10-21
VGL-stGen:肺組織像と空間トランスクリプトミクスのための共有マルチモーダルモデルの学習
原題: VGL-stGen: Learning a shared multimodal model for lung histology and spatial transcriptomics

VGL-stGenは、肺のH&E染色画像と空間トランスクリプトミクスのペアデータに単一細胞リファレンスを組み合わせ、事前学習済みの医用視覚言語モデルを適応させたマルチモーダル大規模言語モデルである。遺伝子条件付きの擬似ラベルによって発現データ側の細胞型教師を組織画像へ転移し、単一のチェックポイントで組織・細胞型分類、遺伝子予測、条件付き発現補完の13の評価タスクに対応する。画像の並べ替え実験は正しく対づけられた組織画像が観測された発現に加えて情報を与えることを示したが、外部分類の一部は注釈系統を共有する計算リファレンスに依存する。