AI 與世界的難題 · 生命科學 · arXiv · 2026-10-20
HyperTaxa:用於廣義微生物分類推論的多尺度基因組表徵
原標題: HyperTaxa: Multiscale Genome Representations for Generalized Microbial Taxonomic Inference
當許多新定序的生物缺乏參考資料涵蓋時,微生物分類推論相當困難,而比對或資料庫工具無法推論訓練中不存在的物種。作者提出 HyperTaxa,將完整基因組編碼為多尺度 k-mer 轉移場,並對齊至源自分類學的空間,實現零樣本與開放集預測。在基準測試與物種不重疊的評估中,它優於偽影像與 Transformer 圖形基線,且在較高分類階層的進步最為顯著。