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AI 與世界的難題 · 醫學與藥物探索 · arXiv · 2026-10-26

編輯前先探測:用於基於結構之藥物設計中 LLM 代理人的探測引導分子最佳化

原標題: Probe Before You Edit: Probing-Guided Molecular Optimization for LLM Agents in Structure-Based Drug Design

以 LLM 代理進行的結構式藥物設計,往往難以同時提升結合親和力與成藥性。作者提出兩項診斷指標,發現目前的代理在修改配體時並不知道結合口袋會如何回應,因此很少能同時取得兩方面的進步。他們提出 PROBE,該方法會建立針對特定口袋的位點圖,執行受控的探測式修改,並將結果用於迭代式多代理最佳化迴圈。在 CrossDocked2020 基準測試中,PROBE 達到最先進的效能,並大幅減輕了診斷指標所揭示的失敗模式。

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