AI与世界难题 · 生命科学 · Nature (machine learning) · 2026-10-05
ProFormer：利用深度学习对单细胞和血浆蛋白质组进行可泛化的分类
原标题: ProFormer: generalizable classification of single-cell and plasma proteomes using deep learning
当前的蛋白质组学工作流程通量低,且需要大量数据处理,这会拖慢样本分类。ProFormer 是一种基于 Transformer 的深度学习流程,可直接从质谱数据中获取 MS1 级肽离子特征。在 14 种架构中,它的表现优于传统机器学习和 CNN,能够按细胞类型、细胞周期阶段和分化轨迹对单细胞蛋白质组进行分类,也能根据血浆蛋白质组判断患者的疾病状态。