ИИ и сложнейшие проблемы мира · Медицина и разработка лекарств · arXiv · 2026-10-26
Проверяй, прежде чем редактировать: оптимизация молекул с помощью зондирования для LLM-агентов в структурном дизайне лекарств
Оригинальное название: Probe Before You Edit: Probing-Guided Molecular Optimization for LLM Agents in Structure-Based Drug Design
Структурное проектирование лекарств с помощью LLM-агентов часто не позволяет одновременно улучшить аффинность связывания и лекарственные свойства. Авторы вводят две диагностические метрики и обнаруживают, что современные агенты редактируют лиганды, не зная, как реагирует карман, поэтому совместные улучшения встречаются редко. Они предлагают PROBE, который строит карту сайта, специфичную для кармана, выполняет контролируемые пробные правки и использует результаты в итеративном мультиагентном цикле оптимизации. На бенчмарке CrossDocked2020 PROBE демонстрирует результаты уровня state-of-the-art и существенно уменьшает проблемы, выявленные диагностикой.