IA e os Problemas Difíceis do Mundo · Medicina e descoberta de medicamentos · arXiv · 2026-10-26
O que se transfere entre bolsões de proteínas? Reutilização de experiência na otimização molecular para o desenho de fármacos baseado em estrutura com agentes
Título original: What Transfers Across Protein Pockets? Experience Reuse in Molecular Optimization for Agentic Structure-Based Drug Design
Agentes de LLM otimizam ligantes em bolsões de proteínas editando passo a passo e fazendo o docking de cada edição, e as sondagens que executam poderiam ser mantidas em uma base de experiência compartilhada. Os autores analisaram o log completo de uma execução em bolsões do conjunto de teste do CrossDocked2020 e constataram que a separação entre edições que melhoram e que pioram era explicada em grande parte por quanto a edição alterou o tamanho molecular, pela ação e pela rodada, e não pelo alvo, embora nomear o alvo separasse essas edições de forma várias vezes mais nítida. Para bolsões não vistos, os sinais transferíveis descreviam principalmente a edição e a molécula resultante, sugerindo que a base é mais útil para priorizar as próprias propostas de docking do agente do que para prescrever o que construir.