AI dan Masalah-Masalah Sulit Dunia · Ilmu hayat · Nature (machine learning) · 2026-10-21
Model dinamis mendalam atas kecepatan multiomik sel tunggal memprediksi gangguan loss-of-function dan rescue pada sel B
Judul asli: Deep dynamical models of single-cell multiomic velocities predict loss-of-function and rescue perturbations in B cells
DynaVelo, sebuah model generatif berbasis persamaan diferensial biasa saraf, mempelajari dinamika gabungan ekspresi gen dan aktivitas motif faktor transkripsi dari data multiome sel tunggal, sehingga memungkinkan perturbasi in silico. Model ini merekonstruksi dinamika in vivo yang mengalami bifurkasi pada sel B sentrum germinal mencit tipe liar dan mengungkap bagaimana dinamika tersebut berubah akibat kehilangan heterozigot Arid1a dan Ctcf. Perturbasi in silico memprediksi Ctcf, Stat3, dan Bcl6 sebagai target penyelamatan bagi kehilangan Arid1a, dan eksperimen in vivo pada mencit heterozigot ganda mengonfirmasi terjadinya penyelamatan pada ketiga kasus tersebut.