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AI और दुनिया की कठिन समस्याएँ · चिकित्सा और दवा खोज · arXiv · 2026-10-26

प्रोटीन पॉकेट्स के बीच क्या स्थानांतरित होता है? एजेंटिक स्ट्रक्चर-बेस्ड ड्रग डिज़ाइन के लिए आणविक अनुकूलन में अनुभव का पुनः उपयोग

मूल शीर्षक: What Transfers Across Protein Pockets? Experience Reuse in Molecular Optimization for Agentic Structure-Based Drug Design

LLM एजेंट प्रोटीन पॉकेट में लिगैंड को चरण-दर-चरण संपादित करके और हर संपादन को डॉक करके अनुकूलित करते हैं, और उनके द्वारा चलाए गए प्रोब को एक साझा अनुभव आधार में रखा जा सकता है। लेखकों ने CrossDocked2020 टेस्ट-सेट पॉकेटों पर एक रन के पूरे लॉग का विश्लेषण किया और पाया कि सुधारने वाले और बिगाड़ने वाले संपादनों का अलगाव काफ़ी हद तक इस बात से समझाया जा सकता था कि संपादन ने आणविक आकार को कितना बदला, कौन-सी क्रिया थी, और कौन-सा राउंड था, न कि लक्ष्य से, हालाँकि लक्ष्य का नाम लेने से यह अलगाव कई गुना अधिक तीक्ष्ण हुआ। अनदेखे पॉकेटों के लिए, हस्तांतरणीय संकेत मुख्य रूप से संपादन और परिणामी अणु का वर्णन करते थे, जो सुझाता है कि यह आधार यह बताने की तुलना में कि क्या बनाना है, एजेंट के अपने डॉकिंग प्रस्तावों को प्राथमिकता देने के लिए अधिक उपयोगी है।

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