L'IA face aux grands problèmes du monde · Médecine et découverte de médicaments · arXiv · 2026-10-26
Sonder avant de modifier : optimisation moléculaire guidée par sondage pour les agents LLM dans la conception de médicaments basée sur la structure
Titre original: Probe Before You Edit: Probing-Guided Molecular Optimization for LLM Agents in Structure-Based Drug Design
La conception de médicaments basée sur la structure avec des agents LLM peine souvent à améliorer conjointement l'affinité de liaison et la druggabilité. Les auteurs introduisent deux métriques de diagnostic et constatent que les agents actuels modifient les ligands sans savoir comment la poche réagit, de sorte que les gains conjoints sont rares. Ils proposent PROBE, qui construit une carte de site spécifique à la poche, effectue des modifications de sondage contrôlées et exploite les résultats dans une boucle d'optimisation multi-agents itérative. Sur le benchmark CrossDocked2020, PROBE affiche des performances de pointe et atténue considérablement les modes de défaillance révélés par les diagnostics.