La IA y los problemas difíciles del mundo · Medicina y descubrimiento de fármacos · arXiv · 2026-10-26
Sondear antes de editar: optimización molecular guiada por sondeo para agentes LLM en el diseño de fármacos basado en la estructura
Título original: Probe Before You Edit: Probing-Guided Molecular Optimization for LLM Agents in Structure-Based Drug Design
El diseño de fármacos basado en la estructura con agentes LLM suele tener dificultades para mejorar conjuntamente la afinidad de unión y la capacidad de convertirse en fármaco. Los autores introducen dos métricas de diagnóstico y descubren que los agentes actuales editan los ligandos sin saber cómo responde el bolsillo, por lo que las mejoras conjuntas son poco frecuentes. Proponen PROBE, que construye un mapa de sitio específico del bolsillo, realiza ediciones de sondeo controladas y usa los resultados en un bucle iterativo de optimización multiagente. En el benchmark CrossDocked2020, PROBE reporta un rendimiento de vanguardia y mitiga sustancialmente los modos de fallo que revelaron los diagnósticos.