KI und die schwierigen Probleme der Welt · Medizin & Wirkstoffforschung · arXiv · 2026-10-26
Erst prüfen, dann bearbeiten: Sondierungsgesteuerte Molekülopimierung für LLM-Agenten im strukturbasierten Wirkstoffdesign
Originaltitel: Probe Before You Edit: Probing-Guided Molecular Optimization for LLM Agents in Structure-Based Drug Design
Strukturbasiertes Wirkstoffdesign mit LLM-Agenten hat oft Schwierigkeiten, Bindungsaffinität und Wirkstoffeignung (Druggability) gemeinsam zu verbessern. Die Autoren führen zwei Diagnosemetriken ein und stellen fest, dass aktuelle Agenten Liganden bearbeiten, ohne zu wissen, wie die Bindungstasche reagiert, sodass gemeinsame Verbesserungen selten sind. Sie schlagen PROBE vor, das eine taschenspezifische Site-Map erstellt, kontrollierte Probe-Änderungen durchführt und die Ergebnisse in einer iterativen Multi-Agenten-Optimierungsschleife nutzt. Auf dem CrossDocked2020-Benchmark erzielt PROBE nach eigenen Angaben state-of-the-art-Leistung und mildert die durch die Diagnosen aufgedeckten Fehlermodi erheblich.