KI und die schwierigen Probleme der Welt · Lebenswissenschaften · Nature (machine learning) · 2026-10-05
ProFormer: verallgemeinerbare Klassifizierung von Einzelzell- und Plasmaproteomen mittels Deep Learning
Originaltitel: ProFormer: generalizable classification of single-cell and plasma proteomes using deep learning
Aktuelle proteomische Arbeitsabläufe haben einen geringen Durchsatz und erfordern eine umfangreiche Datenverarbeitung, was die Klassifizierung von Proben verlangsamt. ProFormer ist eine Transformer-basierte Deep-Learning-Pipeline, die Merkmale von Peptidionen auf MS1-Ebene direkt aus Massenspektrometriedaten übernimmt. Sie übertraf herkömmliches maschinelles Lernen und CNNs über 14 Architekturen hinweg und klassifizierte Einzelzell-Proteome nach Zelltyp, Zyklusphase und Differenzierungsverlauf sowie den Krankheitsstatus von Patienten anhand von Plasma-Proteomen.