AI与世界难题 · 生命科学 · arXiv · 2026-10-23
逃离系统发育陷阱：持续同调通过多模态图神经网络实现跨物种离子通道分类
原标题: Escaping the Phylogenetic Trap: Persistent Homology Enables Cross-Species Ion Channel Classification via Multimodal Graph Neural Networks
蛋白质分类器的随机划分评估可能利用特定分类单元的相关性，从而高估在未见分类单元上的性能，这一问题在按离子通道靶标对毒液化合物分类时尤为突出。作者在 1,373 个毒液化合物上，以留一分类单元法评估，比较了多模态图神经网络中的五种结构归纳偏置。在分类学偏移下，其持续同调模型 PH-GNN 达到 63.4% 的准确率，比次优方法高出 8 个百分点以上，而仅基于序列的基线降至约 30%。