AI与世界难题 · 生命科学 · Nature (machine learning) · 2026-10-05
CellART：从高分辨率空间转录组学中提取单细胞信息的统一框架
原标题: CellART: a unified framework for extracting single-cell information from high-resolution spatial transcriptomics
高分辨率空间转录组学平台要么每个位点只能捕获稀疏的转录本计数，要么只能测量有限数量的基因，这使得单细胞信息难以提取。CellART 结合染色图像、空间转录组学数据和单细胞 RNA-seq 参考数据，利用深度学习和概率建模同时完成细胞分割和细胞类型注释。作者报告称，该方法高效、可泛化且稳健，其输出结果与广泛使用的社区工具兼容。