ИИ и сложнейшие проблемы мира · Науки о жизни · Nature (machine learning) · 2026-10-16
LitGene: интерпретируемая трансформерная модель, объединяющая текст и онтологию для обучения представлений генов
Оригинальное название: LitGene: an interpretable transformer model integrating text and ontology for gene representation learning
Обучение представлений генов часто упускает из виду научную литературу, что может смещать результаты не в пользу малоизученных генов. LitGene — интерпретируемый трансформер, который с помощью контрастного обучения объединяет текст с аннотациями Gene Ontology. Он показал конкурентную точность на восьми белковых бенчмарках, предсказал в режиме zero-shot термины GO, пути KEGG и связи ген—заболевание, а также выделил ANGPTL6 как ген-кандидат идиопатического лёгочного фиброза, что подтверждается дифференциальной экспрессией в независимых образцах.