ИИ и сложнейшие проблемы мира · Науки о жизни · Nature (machine learning) · 2026-10-05
CellART: единая платформа для извлечения информации об отдельных клетках из пространственной транскриптомики высокого разрешения
Оригинальное название: CellART: a unified framework for extracting single-cell information from high-resolution spatial transcriptomics
Платформы пространственной транскриптомики с высоким разрешением либо фиксируют разреженное число транскриптов на пятно, либо измеряют лишь ограниченное число генов, из-за чего трудно извлечь информацию об отдельных клетках. CellART объединяет изображения окрашивания, данные пространственной транскриптомики и референсы одноклеточной РНК-секвенации, используя глубокое обучение и вероятностное моделирование для одновременной сегментации клеток и аннотации их типов. Авторы сообщают, что метод эффективен, обобщаем и устойчив, а его результаты совместимы с широко используемыми инструментами сообщества.