ИИ и сложнейшие проблемы мира · Науки о жизни · arXiv · 2026-10-23
QProtFuse: слияние слоёв под управлением запроса для предсказания функций белков с дополнением поиском
Оригинальное название: QProtFuse: Query-Guided Layer Fusion for Retrieval-Augmented Protein Function Prediction
У больших языковых моделей (LLM) ограниченное понимание белков, а существующие методы белковой генерации с дополнением за счёт поиска (retrieval-augmented) в основном расширяют внешние сигналы поиска, упуская из виду знания внутри белковой языковой модели. Авторы предлагают QProtFuse, который с помощью запросов адаптивно объединяет признаки из нескольких слоёв и совместно обучает поиск белков и аннотаций. На Prot-Inst-OOD он достигает наилучших результатов поиска, а также даёт наивысшие оценки LLM-as-a-judge для описаний функций на последующих задачах с Qwen3-8B и DeepSeek-V4-Pro.