IA e os Problemas Difíceis do Mundo · Ciências da vida · arXiv · 2026-10-20
HyperTaxa: Representações Multiescala de Genomas para Inferência Taxonômica Microbiana Generalizada
Título original: HyperTaxa: Multiscale Genome Representations for Generalized Microbial Taxonomic Inference
A inferência taxonômica microbiana é difícil quando muitos organismos recém-sequenciados não têm cobertura de referência, e ferramentas de alinhamento ou de banco de dados não conseguem inferir espécies ausentes do treinamento. Os autores propõem o HyperTaxa, que codifica genomas completos como campos de transição de k-mers multiescala e os alinha a um espaço derivado da taxonomia, permitindo previsão zero-shot e de conjunto aberto. Ele superou os modelos de referência baseados em pseudoimagens e em grafos de transformers em avaliações de benchmark e de espécies disjuntas, com os maiores ganhos em níveis taxonômicos mais altos.