AI dan Masalah-Masalah Sulit Dunia · Ilmu hayat · arXiv · 2026-10-20
HyperTaxa: Representasi Genom Multiskala untuk Inferensi Taksonomi Mikroba yang Digeneralisasi
Judul asli: HyperTaxa: Multiscale Genome Representations for Generalized Microbial Taxonomic Inference
Inferensi taksonomi mikroba sulit dilakukan ketika banyak organisme yang baru disekuensing tidak memiliki cakupan referensi, dan alat berbasis penyejajaran atau basis data tidak dapat menyimpulkan spesies yang tidak ada dalam data pelatihan. Para penulis mengusulkan HyperTaxa, yang mengodekan genom utuh sebagai medan transisi k-mer multiskala dan menyelaraskannya ke ruang turunan taksonomi, sehingga memungkinkan prediksi zero-shot dan open-set. Metode ini mengungguli baseline pseudo-citra dan transformer-graf pada evaluasi tolok ukur dan spesies terpisah, dengan peningkatan terbesar pada peringkat taksonomi yang lebih tinggi.