AI dan Masalah-Masalah Sulit Dunia · Ilmu hayat · Nature (machine learning) · 2026-10-16
LitGene: model transformer yang dapat diinterpretasikan yang mengintegrasikan teks dan ontologi untuk pembelajaran representasi gen
Judul asli: LitGene: an interpretable transformer model integrating text and ontology for gene representation learning
Pembelajaran representasi gen sering mengabaikan literatur ilmiah, yang dapat membiaskan hasil terhadap gen yang kurang diteliti. LitGene adalah transformer yang dapat diinterpretasikan yang mengintegrasikan teks dengan anotasi Gene Ontology melalui contrastive learning. Model ini mencapai akurasi yang kompetitif pada delapan tolok ukur protein, memprediksi term GO, jalur KEGG, dan hubungan gen-penyakit secara zero-shot, serta menandai ANGPTL6 sebagai gen kandidat untuk fibrosis paru idiopatik, didukung oleh ekspresi diferensial pada sampel independen.