AI dan Masalah-Masalah Sulit Dunia · Ilmu hayat · Nature (machine learning) · 2026-10-05
CellART: kerangka kerja terpadu untuk mengekstraksi informasi sel tunggal dari transkriptomik spasial beresolusi tinggi
Judul asli: CellART: a unified framework for extracting single-cell information from high-resolution spatial transcriptomics
Platform transkriptomik spasial beresolusi tinggi either menangkap jumlah transkrip yang jarang per spot atau hanya mengukur sejumlah gen yang terbatas, sehingga informasi sel tunggal sulit diekstraksi. CellART menggabungkan citra pewarnaan, data transkriptomik spasial, dan referensi RNA-seq sel tunggal, menggunakan deep learning dan pemodelan probabilistik untuk mensegmentasi sel dan menganotasi tipe sel secara bersamaan. Para penulis melaporkan bahwa metode ini efisien, dapat digeneralisasi, dan tangguh, serta keluarannya kompatibel dengan alat komunitas yang banyak digunakan.