AI और दुनिया की कठिन समस्याएँ · जीव विज्ञान · arXiv · 2026-10-20

HyperTaxa: सामान्यीकृत सूक्ष्मजीवी वर्गीकरण अनुमान के लिए बहु-स्तरीय जीनोम निरूपण

मूल शीर्षक: HyperTaxa: Multiscale Genome Representations for Generalized Microbial Taxonomic Inference

जब बहुत से नए अनुक्रमित जीवों के लिए संदर्भ कवरेज उपलब्ध नहीं होता, तब सूक्ष्मजीवी वर्गीकरण अनुमान कठिन हो जाता है, और अलाइनमेंट या डेटाबेस उपकरण प्रशिक्षण में अनुपस्थित प्रजातियों का अनुमान नहीं लगा सकते। लेखक HyperTaxa प्रस्तावित करते हैं, जो संपूर्ण जीनोम को बहु-स्तरीय k-mer संक्रमण क्षेत्रों के रूप में एन्कोड करता है और उन्हें वर्गीकरण-व्युत्पन्न स्थान से संरेखित करता है, जिससे ज़ीरो-शॉट और ओपन-सेट पूर्वानुमान संभव होता है। इसने बेंचमार्क और असंयुक्त-प्रजाति मूल्यांकनों में pseudo-image और transformer-graph आधाररेखाओं से बेहतर प्रदर्शन किया, जिसमें उच्चतर वर्गीकरण श्रेणियों पर सबसे अधिक सुधार हुआ।

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