La IA y los problemas difíciles del mundo · Ciencias de la vida · arXiv · 2026-10-20
HyperTaxa: Representaciones genómicas multiescala para la inferencia taxonómica microbiana generalizada
Título original: HyperTaxa: Multiscale Genome Representations for Generalized Microbial Taxonomic Inference
La inferencia taxonómica microbiana es difícil cuando muchos organismos recién secuenciados carecen de cobertura de referencia, y las herramientas de alineamiento o de bases de datos no pueden inferir especies ausentes del entrenamiento. Los autores proponen HyperTaxa, que codifica genomas completos como campos de transición de k-meros multiescala y los alinea con un espacio derivado de la taxonomía, lo que permite la predicción zero-shot y de conjunto abierto. Superó a los modelos de referencia basados en pseudoimágenes y en grafos con transformers en evaluaciones de referencia y de especies disjuntas, con las mayores mejoras en los rangos taxonómicos superiores.