KI und die schwierigen Probleme der Welt · Lebenswissenschaften · arXiv · 2026-10-19
Harness-gesteuerter agentischer Betrieb der Analyse optischer Pooled Screens
Originaltitel: Harness-Driven Agentic Operation of Optical Pooled Screen Analysis
Optische Pooled Screens verknüpfen genetische Perturbationen mit der Zellmorphologie, doch die Umwandlung der Mikroskopiedaten in Ergebnisse erfordert aufwendige, mehrtägige Analysen mit manueller Parameteranpassung und Fehlersuche. Die Autoren entwickelten Brieflow-auto, ein Claude-Code-Plugin, mit dem ein Coding-LLM die Open-Source-Pipeline Brieflow bedienen kann, indem es Parameter abstimmt, Konfigurationen validiert, sich von Fehlern erholt und die Ausgabequalität prüft. In fünf zuvor analysierten Screens ordnete es mehr Zellen mit Zuversicht einem einzelnen Gen zu als die ursprünglichen manuellen Analysen, und in einem neuen Screen verwandelte es Fehlschläge in geprüfte Upstream-Korrekturen.