الذكاء الاصطناعي ومشكلات العالم الصعبة · علوم الحياة · arXiv · 2026-10-22

مُشفِّر ذاتي يتفوق على نموذجَي ترانسفورمر في التنبؤ بالتعبير الجيني من إتاحة الكروماتين

العنوان الأصلي: An autoencoder outperforms two transformers on prediction of gene expression from chromatin accessibility

نادرًا ما تُقارَن النماذج التي تتنبأ بوفرة RNA من قابلية الوصول إلى الكروماتين ضمن الميزات والأهداف والمقاييس نفسها، لذا بنى المؤلفون معيارًا مرجعيًا يقوم على 126,604 من بروفايلات النوى المفردة المزدوجة من 19 دراسة على البشر، بمفردات مشتركة تضم 50,000 قمة و3,185 جينًا، وقارنوا سبعة خطوط معالجة. وقد تفوّق خط المعالجة scButterfly-B، المبني على مُرمِّزات تلقائية متغيِّرة مزدوجة، على كل خطوط المعالجة القائمة على المحوّلات — بما في ذلك نموذج Perceiver ذاتي الانحدار Omic Translator وإعادة صياغة Cisformer دون عينات دعم — في ارتباط سبيرمان لكل جين وداخل الخلية في جميع مقارنات الطيّات المزدوجة الستين، مع تدريب أقصر بـ 3.8 مرة. وتظل المحوّلات ضمن فارق 0.02-0.04 في شكل البروفايل داخل الخلية، لكنها تتأخر بمقدار 0.10-0.24 في الارتباط لكل جين، وتُظهر الاستئصالات المحددة مسبقًا أن مُرمِّز Perceiver كان يضيف +0.0439 في الارتباط لكل جين داخل المانح الواحد مقارنةً بالانتباه الذاتي الكامل.

اقرأ المصدر الأصلي ↗

جميع العناصر →